tel durchsuchen

Recent Posts

Donnerstag, 19. August 2021

SCHRODINGER SUITES 2021.2 LNX WIN

SCHRODINGER.SUITES.2021.2.LNX.WIN.ISO-TEL

 
SCHRÖDINGER | 2021 | MDF | RAR | 8,26 GB + 6,64 GB | LINUX-WINDOWS

Eroberung von Arzneimittelforschung, Materialforschung und Molekularmodellierung

Die Schrödinger Suite  ist ein umfangreiches Programmpaket für Quantenchemie, und Molekularmechanik. Auf von einer gemeinsamen grafischen Oberfläche „Maestro“, die frei verfügbar ist, können komplexe Moleküle konstruiert und dann  mit den kommerziellen Schrödinger-Modulen wie z.B. „Jaguar“ und „Macromodel“ bezüglich ihrer chemischen und physikalischen Eigenschaften untersucht werden.



Die Schrödinger-Softwaresuite umfasst eine große Anzahl von Anwendungen für eine Vielzahl von Modellierungs-, Analyse- und Berechnungsaufgaben. Im Allgemeinen wird das Programm auf Ihrem lokalen Computer ausgeführt, und es gibt Installationsprogramme für Linux und Windows. Zusätzlich zur lokalen Ausführung können viele, wenn nicht sogar alle Programme auf dem Cluster ausgeführt werden, indem man die Dienstprogramme zur Auftragsübermittlung innerhalb der Suite verwendet.

Eigenschaften und Merkmale der Schrödinger Suites Collection:

    Modellierung von verschiedenen molekularen und chemischen Strukturen
    Modellierung biologischer und biologischer Strukturen
    Modellierung durch Skizzieren und grafisches Ändern von Werten in verschiedenen Fenstern
    Grafische und einfache Anwendungsumgebung
    Analyse und Bewertung des Verhaltens von Materialien unter variablen Umweltbedingungen, z.B. bei sehr niedrigen oder hohen Temperaturen
    Untersuchung der Struktur von Materialien an Atomoberflächen
    Fähigkeit, chemische Berechnungen an modellierten Strukturen durchzuführen
    Möglichkeit der Materialanalyse und gute Quelle für die Entdeckung neuer chemischer Materialien und Strukturen
    Geeignet für pharmazeutische Anwendungen
    Anzeige von Daten und Zahlen in Tabellen und Diagrammen mit unterschiedlichen Farben


Biologics Suite

Umfassende Proteinmodellierung

    Vollständiger Satz von Homologie-Modellierungswerkzeugen, einschließlich schneller und fortgeschrittener Methoden
    Chimäre und multimere Modelle
    Fortgeschrittene Sequenzwerkzeuge für das Multiple Alignment mit umfangreichen Annotationsoptionen
    Qualitätsanalyse der Proteinstruktur
    Identifizierung von Konsenselementen in strukturellen Familien/Homologen

 Erweiterte Funktionen für das Protein-Engineering

    Vorhersage von Proteinaggregation
    Identifizierung von Hot Spots für Proteolyse, Glykosylierung, Deamidierung und Oxidation
    Rückstandsbasierte Analyse von Energien, lösungsmittelbasierten Oberflächenbereichen und Hydropathie
    Cystein-Scanning zur Identifizierung von Rückstandsmutationen für potenzielle Cystein-Cystein-Disulfidbindungen
    Automatisiertes Scannen von Rückständen zur Vorhersage von relativen Stabilitäten sowie von Änderungen der für Lösungsmittel zugänglichen Oberfläche, pKa und Hydropathie

Modellierung von Antikörpern

    Automatisierter intuitiver Arbeitsablauf
    Vorhersage von CDR aus der Sequenz
    Schnelle Vorhersage mit kuratierter Antikörperdatenbank
    Erweiterte ab initio Schleifenvorhersage mit Prime
    Datenbankmanagement-Tools für die einfache Einbindung neuer/eigener Strukturen und für die Verwendung mehrerer Datenbanken bei der Modellierung

Protein-Protein-Docking auf dem neuesten Stand der Technik

    Gut validierter Docking-Code, PIPER; für weitere Informationen besuchen Sie bitte die PIPER-Website.
    Spezielle Antikörper- und Multimermodi

Fortgeschrittene Simulationen

    Zugang zu Schrödinger-Simulationswerkzeugen
    Erweiterte Molekulardynamik (MD)
    Umfangreiche FEP-Werkzeuge (Free Energy Perturbation)
    Großmaßstäbliche, niedermolekulare (normale) Suche nach Domänenbewegungen
    Quantenmechanik/Molekularmechanik (QM/MM) Vorhersagen der Reaktivität von Bindungsstellen

Small-Molecule Drug Discovery Suite
Breites Spektrum an virtuellen Screening-Optionen, die das gesamte Spektrum der Kompromisse zwischen Geschwindigkeit und Genauigkeit abdecken

    2D/3D QSAR mit einer großen Auswahl an Fingerprint-Optionen
    Formbasiertes Screening, mit oder ohne Atomeigenschaften
    Ligandenbasierte Pharmakophor-Modellierung
    e-Pharmakophor-Modellierung unter Einbeziehung von Ligand-Rezeptor-Interaktionsenergien
    Flexibles Liganden-Docking mit dem branchenführenden Glide
    SIFt - Struktur-Interaktions-Fingerprint-Analyse
    Induced-fit docking mit Rezeptorflexibilität
    Kovalentes Docking
    2D-Ligandenwechselwirkungsdiagramme

Fortgeschrittene Berechnungen zur Abschätzung der Bindungsaffinität und zur Rangordnung der Verbindung

    Post-Docking-Verfeinerung einbeziehen
    Primäre MM/GBSA
    Theorie der Störung der freien Energie (FEP)
    Lineare Wechselwirkungsannäherung (LIA)
    QM-polarisiertes Liganden-Docking

Analysen zur Vorhersage, Vorbereitung, Verfeinerung und Charakterisierung von Zielstruktur und Bindungsmodi

    Verfeinerung der Kristallstruktur von Proteinen
    Proteinstrukturanalyse und Homologiemodellierung
    Modellierung von GPCR und hERG
    Identifizierung und Analyse von Proteinbindungsstellen
    Vorhersage mehrerer Bindungsmodi

Komplettes Set von Dienstprogrammen zur Vorbereitung, Analyse und Filterung von Ligandenstrukturen und zur Erstellung und Gestaltung von Ligandenbibliotheken

    Umwandlung von 2D- in 3D-Strukturen, mit Schwerpunkt auf bioaktiven Konformeren
    Aufzählung und Analyse tautomerer Zustände
    Ligandeninteraktionsdiagramm
    Kommerziell verfügbare Verbindungsdatenbank
    Flexible Ligandenüberlagerung
    Kombinatorische Bibliothekserstellung
    Kern-Hopping
    Filtern von Substanzbibliotheken basierend auf vorhergesagten ADME-Eigenschaften
    R-Gruppen-Analyse

Allgemeine Modellierungstools, die in einem breiten Spektrum chemischer Systeme angewendet werden können

    Leistungsstarke QM-Berechnungen, in der Gasphase und in Lösung
    MM/MD-Simulationen, mit impliziten oder expliziten Lösungsmitteln
    Konformationsanalysen für kleine Moleküle und Makromoleküle
    Mixed-Mode QM/MM Berechnungen für Grundzustands- und Reaktivitätsstudien

Umfassende Unterstützung durch modernste Visualisierungs- und Workflow-Automatisierungstools

     Einheitliche grafische Benutzeroberfläche, Maestro, die alle Berechnungen unterstützt
    Grafiken in Publikationsqualität und flexible Analysen
    KNIME-Erweiterungen und anpassbare Arbeitsabläufe
    Python-API

BETRIEBSSYSTEM:

LINUX

.TEL\VERLASSEN

BETRIEBSSYSTEM:

WINDOWS

.TEL\VERLASSEN


 

0 Kommentare:

Kommentar veröffentlichen