MOLECULAR OPERATING ENVIRONMENT V2019.0102 WIN64

MOLECULAR.OPERATING.ENVIRONMENT.V2019.0102.WIN64-TEL

 

CHEMICAL COMPUTING GROUP | 2019 | EXE | RAR | 5,29 GB | WINDOWS

Integrierte Plattform für computergestütztes Moleküldesign. Kleine Moleküle - Peptide - Biologics (Biologika)

3D-Visualisierung von Molekülen

    Leicht zu bedienende grafische Schnittstelle
    Erkennung und Analyse von aktiven Stellen
    Moleküloberflächen und Elektronendichte
    Visualisierung nicht-gebundener Wechselwirkungen
    Bilder und Filme in Publikationsqualität
    GPU-beschleunigte 3D-Stereografien
    Gemischte virtuelle Realität und 3D-Druck

Strukturbasierter Entwurf

    Optimierte Schnittstelle für Ligandendesign
    Erkennung und Analyse von aktiven Stellen
    Interaktives Ligandendesign in der Tasche
    Protein-Ligand-Interaktionsdiagramme
    Vorhersage von Wasserstellen und Energetik
    Docking mit induzierter Passung
    Verknüpfen, Wachsen und Ersetzen von Fragmenten

Entwurf von Antikörpern und Biologika

    Strukturbasiertes Protein-Engineering
    Bewertung von Verbindlichkeiten und Entwicklungsfähigkeit
    Optimierung von Affinität, Stabilität und Löslichkeit
    Modellierung von Antikörpern im Hochdurchsatzverfahren
    Virtuelle Bibliotheken generieren
    Protein-Docking und Epitop-Kartierung
    Modellierung von ADCs und Fusionsproteinen

MOEsaic - SAR-Erforscher

    SAR- und SPR-Visualisierung
    Free-Wilson-Verbindungsvorschläge
    Abgestimmte Molekülpaare
    R-Gruppen-Analyse und Profiling
    Substruktur- und Ähnlichkeitssuche
    Entwurf neuartiger virtueller Verbindungen
    Ideen dokumentieren und Sitzungen austauschen

Ligandenbasierter Entwurf

    Konformationserzeugung und Clustering
    Kleine Moleküle ausrichten und überlagern
    MOEsaic für SAR-Exploration
    Pharmakophoraufklärung und Screening
    Generierung von QSAR-Modellen - MOE-Deskriptoren
    Torsionsprofile für die Konformationsanalyse
    Kombinatorische Bibliotheksaufzählung

Modellierung von Proteinen, DNA/RNA

    Visualisierung von Proteinen, Patches und Grenzflächen
    Vorhersage der 3D-Proteinstruktur aus der Sequenz
    Erstellen von DNA/RNA-Modellen
    Mutationen und Rotamere erforschen
    Molekulardynamik-Simulationen
    Loop/Linker-Suche und Sampling
    Protein-Protein-Docking

Virtuelles Screening

    3D-Pharmakophor-Screening
    Form- und Merkmalsbeschränkungen
    Docking von kleinen Molekülen
    2D- und 3D-Fingerprint-Screening
    Gerüst und Fragment-Ersatz
    Konformationsdatenbanken
    Reaktionsbasiertes Bibliotheksdesign

Fragment-basierte Entdeckung

    Gerüst-Hopping
    Fragmentverknüpfung und -erweiterung
    Medizinisch-chemische Transformationen
    Kombinatorische Bibliotheksaufzählung
    Multi-Fragment-Suche
    Liganden-Hybridisierung (BREED)
    Kundenspezifische Fragmentbibliotheken

Strukturelle Bioinformatik

    Mehrfache Sequenz- und Strukturanpassung
    Annotieren von 3D-Eigenschaften auf Sequenzen
    Erstellen und Durchsuchen von Proteinfamilien-Datenbanken
    Strukturelle Daten auswerten
    Analysieren von konservierten Resten
    Generierung geclusterter phylogenetischer Stammbäume
    Strukturelle Datenbanken für Antikörper und TCR

Molekulare Simulationen

    Molekulare Mechanik und Dynamik
    Automatisierte Strukturvorbereitung
    Berechnungen der freien Energie
    Flexible Ausrichtung von mehreren Molekülen
    Konformationsanalyse - LowModeMD
    Torsionsscan und -analyse
    QM-basierte NMR-, IR- und VCD-Spektren

Modellierung von Peptiden

    Makrozyklische und lineare Peptide
    Identifizierung von Peptid-Protein-Kontakten
    Konformations-Suche  
    Aufzählung nicht-natürlicher Peptidbibliotheken
    Strukturbasiertes Peptiddesign
    Optimieren von Peptideigenschaften
    Peptid-Docking

Strukturelle Biologie

    Darstellung von Elektronendichten und Differenzenkarten
    Anzeige von Kristallgittern und Kontakten
    Vorhersage von Wasserpositionen
    Elektronendichte-gesteuertes Docking
    Erstellen von Datenbanken mit ausgerichteten Proteinfamilien
    Homologiemodellierung für molekulare Ersetzung
    Gesundheitscheck von Proteinstrukturen

Cheminformatik und QSAR

    Über 400 2D- und 3D-Moleküldeskriptoren
    pKa-Vorhersage und Protomergenerierung
    Lineare QSAR/QSPR
    Bayes'sche Klassifikation / Maschinelles Lernen
    MOEsaic - Abgestimmte Molekülpaare
    Gezieltes kombinatorisches Bibliotheksdesign
    Chemische Ähnlichkeit, Diversität und Clustering

Anpassung und Einsatz

    Laptop - Cluster - Wolke - Pipeline
    Windows - Linux - macOS
    Integrierte Programmierumgebung (SVL)
    Integration von Drittanbieter-Software
    Benutzerdefinierte Anwendungen und Benutzerprofile
    Web-Integration, Webdienste, API
    HTTP-Listener für Fernsteuerung

PSILO® - Strukturdatenbank

    RCSB-konformes Repository
    Browser-Schnittstelle - 3D-Visualisierung
    Automatisierte Projektdatenbank-Kuration
    3D-Interaktionssuche und Statistik
    Taschenähnlichkeitssuche
    Proteinstruktur-Ausrichtung
    Standard-IT-Infrastruktur

BETRIEBSSYSTEM:

WINDOWS

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