HYPERCUBE.HYPERCHEM.2011.V8.0.10.WIN-TEL
HyperChem ist eine hochentwickelte Molekularmodellierungsumgebung, die für ihre Qualität, Flexibilität und Benutzerfreundlichkeit bekannt ist. Durch die Kombination von 3D-Visualisierung und Animation mit quantenchemischen Berechnungen, Molekularmechanik und -dynamik stellt HyperChem mehr Molekülmodellierungswerkzeuge zur Verfügung als jedes andere Windows-Programm.
Zu den Berechnungsmethoden gehören Molekularmechanik, Molekulardynamik, semi-empirische und ab-initio-Molekülorbitalmethoden sowie die Dichtefunktionaltheorie. HyperChem Data und HyperNMR sind als Teil von HyperChem enthalten. Es werden laufend neue Funktionen hinzugefügt, darunter elegantes Open GL-Rendering, TNDO, RM1, Charmm-Protein-Simulationen, Moleküle in Magnetfeldern, Schnittstellen zu Anwendungen von Drittanbietern, Berechnungen von Strukturen, Spektren, Geschwindigkeitskonstanten und vieles mehr. HyperChem ist sowohl auf Makromoleküle als auch auf kleine Moleküle anwendbar und ist skriptfähig.Struktureingabe und -manipulation
Der Aufbau von Molekülen mit HyperChem ist einfach: Wählen Sie einfach ein Element aus dem Periodensystem aus, und klicken und ziehen Sie mit der Maus, um eine Struktur zu skizzieren. Mit der Maus können Sie die Rotation um Bindungen, die Stereochemie und das "Rubberbanding" von Bindungen steuern und so die Struktur leicht verändern. Umfassende Auswahl-, Hervorhebungs- und Anzeigefunktionen erleichtern die Konzentration auf Bereiche, die in komplexen Molekülen von Interesse sind. Funktionen
Einige der in der letzten Version der HyperChem Software implementierten Funktionen sind:
- Darstellung von Strukturen mit Kugel und Stab, verschmolzenen CPK-Kugeln, Stäben, Kugel und Zylinder oder Röhren.
- Hinzufügen von Van-der-Waals-Punkten zu jedem Rendering.
- Sie können jedes Rendering auf jedes Atom desselben Moleküls anwenden.
- Bestimmen Sie die Breite von Stäbchen oder Zylindern und die Radien von Kugeln.
- Stereo- und perspektivische Darstellung sind ebenso möglich wie eine Qualitätseinstellung.
- Einzelpunktberechnungen bestimmen die molekulare Energie und Eigenschaften für eine gegebene feste Geometrie.
- Berechnungen zur Geometrieoptimierung verwenden Algorithmen zur Energieminimierung, um stabile Strukturen zu finden. Es stehen fünf Minimierungsalgorithmen zur Verfügung. - Schwingungsfrequenzberechnungen finden die normalen Schwingungsmoden einer optimierten Struktur. Das Schwingungsspektrum kann angezeigt werden, und die mit bestimmten Übergängen verbundenen Schwingungsbewegungen können animiert werden.
- Bei der Suche nach Übergangszuständen werden die metastabilen Strukturen, die den Übergangszuständen entsprechen, entweder mit der Eigenvektorfolge- oder der Synchronous Transit-Methode gefunden. Die molekularen Eigenschaften werden dann berechnet.
- Langevin-Dynamik-Simulationen fügen der konventionellen Molekulardynamik Reibungs- und stochastische Kräfte hinzu, um Lösungsmittelkollisionseffekte zu modellieren, ohne explizite Lösungsmittelmoleküle einzubeziehen.
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