GENE.CODES.SEQUENCHER.2016.V5.4.6.BUILD.46289-TEL
GCS | 2016 | EXE | RAR | 275 MB | WINDOWS
DNA-SEQUENZIERUNG DER NÄCHSTEN GENERATION (NGS)
Sequencher unterstützt den Benchtop-Wissenschaftler, indem es die neuesten, von Experten begutachteten NGS-Algorithmen aus der Kommandozeile in eine intuitive Point-and-Click-Oberfläche bringt. Ob Sie referenzgeführte Alignments, de novo Assemblierung, Variantenaufrufe oder SNP-Analysen durchführen, Sequencher hat die Werkzeuge, die Sie brauchen, um Ergebnisse zu erzielen. Sequencher hat die umfassende Cufflinks-Suite für eine tiefgehende Transkriptanalyse und differentielle Genexpression Ihrer RNA-Seq-Daten integriert. Sequencher kann auf einfache Weise einzigartige Visualisierungen Ihrer RNA-Seq-Daten mit benutzerdefinierten Plots und Diagrammen erzeugen, die Ihnen in Sekundenschnelle publikationsreife Grafiken liefern.
Sanger-DNA-Analyse
Die umfangreichen Sanger-Analysefunktionen von Sequencher sind die Grundlage, auf der das Programm aufgebaut wurde. Von Anfang bis Ende anpassbar, gibt es kein anderes Programm, das Ihnen so viel Leistung bietet wie Sequencher. Mit einer einfach zu bedienenden Benutzeroberfläche, die über 25 Jahre lang verfeinert wurde, werden sich Erstanwender in wenigen Minuten wie Profis fühlen. Vom Trimmen der Reads, über benutzerdefinierte Assemblierungs- und Alignment-Algorithmen, Variations-Tabellen, zusammenfassende Berichte bis hin zu Annotationen - die Liste lässt sich beliebig fortsetzen. Sehen Sie selbst, warum Sequencher in zehntausenden von Forschungsartikeln und Fachzeitschriften veröffentlicht wurde. Leistung mit Einfachheit.
Neue und erweiterte Funktionen für Ihre gesamte DNA-Sequenzanalyse.
Sanger:
Senden Sie Primerpaar-Sequenzen aus Primer-BLAST-Läufen in Sequencher Connections an Ihr Sequencher-Projekt.
Einfache Verwendung von Konsenssequenzen aus dem Projektfenster als Referenzsequenz für NGS-Alignments für Hybridsequenzierungsprojekte.
Neuer Befehl "Batch Revert Trim Ends".
Möglichkeit, die Schriftgröße im Projektfenster anzupassen.
NGS:
Schnellere GSNAP und BWA-MEM Arbeitsabläufe.
Erstellen von GSNAP-Datenbanken und BWA-Indizes, die für das Alignment an ganzen Genomen wiederverwendet werden können.
Anzeigen und Speichern von Qualitätsscores und Metadaten Ihrer NGS-Rohdatendateien mit FastQC-Berichten.
Generieren Sie Variant Calling Files (VCF) zur Markierung von Varianten in Ihren NGS-Alignments mit SAMtools.
RNA-Seq:
Erweiterte Cufflinks-Suite mit der Hinzufügung von Cuffquant und Cuffnorm.
Ein einzigartiger Conditions und Replicates Editor für Cuffdiff und Cuffnorm.
Verbesserte RNA-Seq-Visualisierungen mit benutzerdefinierten Sortier- und Filteroptionen.
Einfache Verwaltung aller Ihrer DNA-Seq- und RNA-Seq-Projekte mit einem verbesserten externen Datenbrowser.
Aktuelle Version 2021: 5.4.6
BETRIEBSSYSTEM:
WINDOWS
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